Cradle
Cradle是面向生物研究领域的蛋白质设计辅助平台，依托预测算法与AI技术为生物科研人员提供蛋白质优化设计支持
Cradle是面向生物研究领域的蛋白质设计辅助平台，依托预测算法与AI技术为生物科研人员提供蛋白质优化设计支持。平台支持蛋白质潜力分析预测、AI候选序列生成、实验数据迭代训练模型等功能，无需高通量实验设备也可在常规96孔板实验场景下开展研究。目标用户涵盖基础生物学研究者、合成生物学科研人员、生物医药研发人员、蛋白质工程从业者等，可应用于蛋白质性能改造、酶制剂优化、药物靶点蛋白设计、工业用蛋白质研发等多个科研与产业场景，帮助用户缩短蛋白质研发周期，降低实验试错成本。
- 适用对象
- 高校生物学研究者(基础蛋白质功能研究)
- 主要功能
- 蛋白质潜力分析、AI候选蛋白生成
- 计费方式
- 免费增值，部分功能付费
- 平台
- 网页
- 已收录
- 2026.06.14（141 天）
阅读目录
编辑评测与站内热度
编辑综合评分
满分 5 分
六维指标基于站内真实数据（热度、社区反馈、资料完整度、可达性核验等）综合评估，非用户投票。
全站热度排名
#4751
分类内排名
#54 / 188
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近 7 日点击
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排名与点击为站内真实统计口径，反映 Toolifai 用户行为，非编辑评分。
Cradle是什么，怎么使用？
约 4 分钟Cradle是面向生物研究领域的蛋白质设计辅助平台，依托预测算法与AI技术为生物科研人员提供蛋白质优化设计支持。平台支持蛋白质潜力分析预测、AI候选序列生成、实验数据迭代训练模型等功能，无需高通量实验设备也可在常规96孔板实验场景下开展研究。目标用户涵盖基础生物学研究者、合成生物学科研人员、生物医药研发人员、蛋白质工程从业者等，可应用于蛋白质性能改造、酶制剂优化、药物靶点蛋白设计、工业用蛋白质研发等多个科研与产业场景，帮助用户缩短蛋白质研发周期，降低实验试错成本。
主要功能
- 蛋白质潜力分析：用户上传待研究的蛋白质序列后，平台可对序列的各项潜在性能进行可视化分析，呈现序列的关键结构特征、可能的功能活性区间等信息，帮助研究者快速筛选出具备研究价值的候选序列，减少前期盲选实验的工作量。
- AI候选蛋白生成：用户设定需要优化的蛋白质性能方向，如结合能力、催化效率等参数后，点击生成按钮即可得到平台AI输出的优化后候选蛋白质序列，序列符合设定的优化方向，可直接用于后续实验验证，减少人工设计序列的耗时。
- 实验数据迭代训练：用户将每一轮实验得到的性能验证结果上传至平台，平台会基于这些专属实验数据对AI模型进行微调训练，逐步生成适配用户具体研究项目的定制化模型，后续生成的候选序列匹配度会随着数据积累逐步提升。
- 低通量实验适配：平台的算法模型针对小规模实验场景进行了优化，即使没有高通量实验设备，用户仅使用常规96孔板开展实验，上传对应的实验数据后也能支撑模型的迭代优化，得到符合预期的序列优化建议，降低了平台的使用门槛。
- 数据安全与知识产权保护：用户上传的所有蛋白质序列、实验数据等信息均采用加密存储，平台不会私自使用用户的研究数据，所有基于用户数据生成的研究成果对应的知识产权完全归属用户所有，符合科研机构与企业的信息安全管理要求。
- 扩展功能预告：平台后续将上线蛋白质三维结构预测、热稳定性优化序列生成、密码子优化等功能，用户可在平台内查看功能更新进度，待功能上线后无需额外对接即可直接使用，覆盖更多蛋白质研究的常见需求场景。
怎么使用
- 访问Cradle官网完成账号注册，科研机构用户可提交相关资质认证，获取对应权限的使用资格，注册过程需填写基本的研究方向信息以便平台匹配初始服务。
- 进入项目创建页面，填写研究项目的基础信息，包括目标蛋白质类型、需要优化的具体性能方向、实验条件等参数，完成项目的初始化设置。
- 上传已有的蛋白质原始序列与过往实验数据，平台会自动对数据进行解析与预处理，生成初始的序列分析报告供用户查看参考。
- 在优化界面设定具体的优化要求，点击生成按钮获取AI输出的候选蛋白质序列，可对序列进行批量导出，用于后续的实验验证环节。
- 完成一轮实验后，将实验得到的性能结果上传至对应项目中，平台会自动更新定制模型，后续生成的序列会结合新的实验数据进一步优化。
适合什么人群
- 高校生物学研究者(基础蛋白质功能研究)
- 合成生物学科研人员(人工合成蛋白设计)
- 生物医药研发人员(药物靶点蛋白优化)
- 蛋白质工程从业者(工业用酶改造)
- 农业生物技术研究员(抗逆蛋白研发)
- 生物初创企业研发人员(创新蛋白产品开发)
总结
该平台是生物科研领域聚焦蛋白质设计的AI辅助工具，区别于通用的生物信息分析平台，它的核心能力围绕蛋白质优化设计的全流程搭建，从序列分析、候选生成到数据迭代形成了完整的闭环。对于没有高通量实验条件的中小实验室或者小型研发团队来说，其适配低通量实验的特性降低了AI辅助蛋白质研究的使用门槛，不需要投入大量设备成本就可以借助AI能力提升研发效率。同时平台明确的知识产权归属规则，也打消了很多研发团队对于数据安全和成果归属的顾虑，适合不同规模的科研团队在蛋白质改造项目中使用。目前平台还在持续拓展三维结构预测、密码子优化等功能，后续覆盖的研究场景会更加全面，对于长期开展蛋白质相关研究的团队来说，是一个可以长期积累项目数据、逐步提升研发效率的工具。
价格与免费额度
平台提供免费使用版本，免费版支持创建最多3个研究项目，每月可生成最多50条候选蛋白质序列，可使用基础的序列分析功能，适合个人研究者或者小型预研项目使用。付费版采用订阅制，根据可创建项目数量、每月序列生成上限、定制模型训练权限等不同权益分为不同档位，价格根据用户需求进行个性化报价，团队用户或者有大规模研发需求的用户可联系平台获取定制方案，付费版还可享受专属的技术支持服务。
优点与不足
优点
- 实现蛋白质设计全流程覆盖，从序列分析、候选生成到实验数据迭代训练形成完整服务闭环
- 适配低通量实验场景，仅需96孔板实验数据即可支撑模型迭代，降低使用门槛
- 明确知识产权归属，用户上传数据与生成成果完全归属用户，保障研发权益
- 操作流程简化，设定优化方向后即可一键生成候选序列，降低操作复杂度
- 数据加密存储，保障用户研究数据的隐私安全，符合科研数据管理规范
不足
- 部分功能尚未上线，如三维结构预测、密码子优化等需求暂时无法满足
- 定制模型的优化效果依赖用户上传的实验数据量，数据较少时模型精度有限
- 目前主要聚焦蛋白质序列优化，暂不支持复杂的蛋白质复合物设计相关需求
- 无中文操作界面，对于国内不熟悉英文的科研人员存在一定使用门槛
能帮你做的 8 件事
- 01蛋白质潜力分析
- 02AI候选蛋白生成
- 03实验数据迭代训练
- 04低通量实验适配
- 05蛋白质设计场景的常用方案
- 06AI生物科研场景的常用方案
- 07高校生物学研究者(基础蛋白质功能研究)的日常效率工具
- 08先用免费额度验证需求再决定付费
更新历史
- 页面资料核验与信息更新
- Cradle 收录进 Toolifai 目录
常见问题
使用Cradle生成的蛋白质序列相关知识产权归属谁？
平台明确规定，用户上传的所有原始数据、实验结果，以及基于用户专属数据生成的所有候选蛋白质序列、定制化模型等研究成果，对应的知识产权完全归属于用户所有。平台不会以任何形式使用用户的私有数据进行对外服务或者成果转化，也不会主张任何相关的知识产权权益，用户可以放心将研究项目的数据上传至平台，符合科研机构和企业对于研发成果归属的管理要求。
没有高通量实验设备可以使用Cradle吗？
可以使用，平台的算法模型针对低通量实验场景做了专门的优化，即使用户仅通过常规96孔板开展实验，上传对应的实验验证结果，也可以支撑平台的AI模型进行迭代训练，输出适配用户实验条件的优化序列。这一设计降低了AI辅助蛋白质设计的使用门槛，不需要投入大量资金搭建高通量实验平台，中小实验室或者初创研发团队也可以借助AI能力提升蛋白质研发的效率。
Cradle支持哪些类型的蛋白质优化需求？
目前平台支持蛋白质结合能力、催化活性、表达量等常见性能方向的优化，用户在创建项目时可以明确标注需要优化的具体性能指标，平台AI会围绕设定的指标生成对应的候选序列。后续平台还将上线热稳定性优化、密码子优化等功能，覆盖更多蛋白质优化的常见需求。如果用户有特殊的定制化优化需求，也可以联系平台团队沟通适配方案，平台可根据用户的具体研究场景调整模型的优化方向。
Cradle生成的候选序列可以直接用于实验吗？
平台生成的候选序列是基于AI预测的优化结果，符合用户设定的性能优化方向，用户可以直接导出序列用于后续的实验验证。不过蛋白质的实际性能会受到表达体系、实验条件等多种因素的影响，AI预测结果无法完全替代实验验证，用户需要结合自身的实验体系对生成的序列进行测试，再将测试结果上传到平台，进一步迭代优化模型，提升后续生成序列的匹配度。
后续上线的新功能需要额外付费吗？
平台后续上线的通用功能，如蛋白质三维结构预测、基础版热稳定性序列生成、密码子优化等，会根据用户的订阅档位开放对应权限，现有付费订阅用户在订阅期内可以直接使用对应档位包含的新功能，无需额外支付费用。如果是定制化的特殊功能需求，用户可以和平台团队单独沟通，根据需求的复杂程度评估是否需要额外支付开发费用，通用功能的更新不会额外增加用户的使用成本。
开始使用 Cradle
从官方入口了解最新功能与使用方式。
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