TwistlyCells

TwistlyCells是专注于单细胞数据分析的AI平台，核心定位为生物研究领域的AI辅助分析工具，可实现单细胞测序数据的自动化预处理、细胞类型智能注释、细胞分化轨迹预测等功能，面向生物信息研究员、高校生命科学专业师生、生物医药研发人员等群体，适用于单细胞转录组学研究、疾病发病机制探索、药物靶点筛选、发育生物学研究等场景，帮助用户降低单细胞数据分析的技术门槛，提升研究效率。

主要功能

• 数据预处理：用户上传原始单细胞测序fastq文件或表达矩阵后，系统可自动完成数据质量控制、批次效应校正、低质量细胞过滤、归一化等标准化处理步骤，无需用户手动编写复杂分析代码，输出可直接用于后续分析的高质量数据集，减少人工处理带来的误差，缩短预处理耗时。
• 细胞类型注释：平台内置涵盖多个物种、多个组织类型的参考细胞标记基因数据库，结合预训练的AI分类模型，可自动匹配细胞表达特征，快速标注不同细胞群的具体类型，同时支持用户上传自定义标记基因库调整注释结果，输出带注释信息的细胞聚类可视化图表，方便用户快速识别样本中的细胞组成。
• 轨迹分析预测：用户选择目标细胞类群后，系统可基于拟时序分析算法构建细胞分化轨迹，自动识别分化过程中的关键基因表达变化趋势，输出轨迹可视化图谱以及动态表达基因列表，帮助研究人员探索细胞发育、转分化等过程的分子机制，为发育研究和疾病进展分析提供数据支撑。
• 差异表达分析：支持用户自定义分组对比规则，例如对比疾病组和对照组的同一类细胞，系统可自动计算组间的差异表达基因，输出包含差异倍数、显著性p值等统计指标的结果表格，同时提供火山图、热图等可视化结果，方便用户快速筛选与表型相关的关键基因。
• 富集分析工具：用户上传筛选得到的差异基因列表后，平台支持GO功能富集、KEGG通路富集、Reactome通路富集等多种分析功能，自动生成富集结果气泡图、富集通路网络图等可视化内容，帮助用户解析差异基因参与的生物学功能和调控通路，为后续机制研究提供方向。
• 结果导出分享：所有分析结果支持多种格式导出，包括矢量格式的可视化图表、csv格式的分析表格、完整的分析报告文档，同时支持生成加密的分享链接，用户可将分析结果共享给项目协作人员，对方无需注册即可查看相关分析内容，提升团队协作效率。

怎么使用

1. 第一步，访问TwistlyCells官网，点击首页注册按钮，使用邮箱完成账号注册并登录，新用户可先查看平台提供的新手操作教程和示例数据集，了解基本操作流程。第二步，点击页面上传按钮，按照系统提示上传单细胞测序原始数据或表达矩阵，可选择公开参考数据集也可上传自有研究数据，上传时标注数据对应的物种、组织类型等信息。第三步，在分析功能模块选择需要使用的分析工具，可按照研究需求依次选择预处理、细胞注释、差异分析等功能，自定义设置各分析步骤的参数，也可直接使用系统默认参数。第四步，等待系统完成分析，过程中可随时查看任务进度，分析完成后系统会发送通知，用户可在线查看各类可视化分析结果，核对数据准确性。第五步，确认分析结果无误后，可选择需要的格式导出结果，或者生成分享链接发送给协作人员，也可将分析项目保存至个人工作空间，方便后续再次调整分析。

适合什么人群

• 生物信息学研究员（单细胞测序数据分析场景）
• 高校生命科学专业学生（课程实验、毕业设计场景）
• 生物医药研发人员（药物靶点筛选、药效评估场景）
• 临床研究人员（疾病分子机制探索、生物标志物发现场景）
• 发育生物学研究者（细胞分化、胚胎发育研究场景）
• 免疫学科研人员（免疫细胞亚群鉴定、免疫应答机制研究场景）

总结

在单细胞测序技术快速普及的当下，很多研究人员面临数据分析门槛高、代码编写能力不足、分析流程标准化程度低的问题，这个平台的出现很好地回应了这类需求。它将原本需要生物信息人员通过代码实现的复杂分析流程，封装为可视化的交互功能，即使是没有编程基础的湿实验研究人员，也可以完成从原始数据到结果输出的完整分析流程。平台内置的多物种参考数据库覆盖了常见的研究场景，同时保留了足够的自定义空间，支持用户上传自己的参考基因集调整分析参数，兼顾了易用性和灵活性。相比于同类分析工具，它的分析结果可视化程度更高，各类图表可以直接用于论文配图的初步制作，能够节省研究人员大量的绘图时间。不过需要注意的是，AI自动分析的结果依然需要研究者结合自身的研究背景进行验证，不能直接替代专业的生物信息分析人员的解读，适合作为研究过程中的辅助工具使用。

价格与免费额度

平台提供免费版和多梯度付费版，免费版支持上传不超过1GB的测序数据，可使用基础的预处理、细胞注释功能，每月可完成3个分析项目，适合学生课程练习或小规模预实验使用。基础付费版价格为每月49美元，支持上传不超过10GB数据，解锁所有基础分析功能，每月可完成20个分析项目，适合小型研究团队日常使用。专业付费版价格为每月149美元，无数据上传大小限制，支持自定义分析流程，享有优先任务调度权限，还可获取专属技术支持，适合需要大量处理单细胞数据的实验室或研发团队使用。同时平台还提供按项目付费的选项，单个项目分析价格根据数据量从29美元到99美元不等，适合偶发性数据分析需求的用户。

优点与不足

能帮你做的 8 件事

1. 01数据预处理
2. 02细胞类型注释
3. 03轨迹分析预测
4. 04差异表达分析
5. 05单细胞数据分析场景的常用方案
6. 06生物信息工具场景的常用方案
7. 07生物信息学研究员（单细胞测序数据分析场景）的日常效率工具
8. 08先用免费额度验证需求再决定付费

更新历史

• 2026.06.14TwistlyCells 收录进 Toolifai 目录
• 页面资料核验与信息更新

常见问题